萨尔茨堡莫扎特大学积极参与国际合作，与国内外多所高校有密切的合作关系，比如萨尔茨堡大学，布鲁塞尔伊拉斯谟应用科学大学，海德堡教育学院，柏林艺术大学，汉堡音乐戏剧学院，科隆音乐学院，爱丁堡大学，伦敦皇家音乐学院，奥胡斯皇家音乐学院，威尼斯美术学院，阿姆斯特丹音乐学院，格拉纳达大学，哥德堡大学，塞维利亚高等音乐学院，马德里皇家高等音乐学院，乌普萨拉大学等等。 萨尔茨堡莫扎特大学开设了本科、研究生专业，专业主要涵盖艺术领域，比如音乐理论，作曲，演唱，乐器教育，音乐教育，指挥等等。