耶拿应用科技大学前身是成立于16世纪的光学研究机构，后来成为耶拿大学，1991年由耶拿大学与图林根州共同建立的耶拿应用科技大学。耶拿应用科技大学的优势课程也是以光学，以及相关的物理学，包括一些材料科学的高科技学科。德国是工业极其发达的国家，耶拿应用科技大学也与世界范围内超过400家高科技的公司有相当密切的合作，如大家耳熟能详的奥林巴斯，上面提到的卡尔蔡司，以及Jenoptik AG， Schott JENA Glas AG， Analytik Agt Interxhop AG 这些精密仪器，生物工程和信息技术的企业等，所以学生具有很高的应用能力，而教学更是偏重应用方面的能力。

　　耶拿应用科技大学也积极与世界知名高校进行学术、文化交流，如：中国海洋大学、北京信息科技大学。