纳瓦那大学拥有10个系，两个技术学校，两个附属学校，7个学院、14个研究中心。 A.研究生院课程：　提供生物学硕士、生物化学硕士、化学硕士、药理学硕士、企业方向与管理硕士、经济学硕士、法律学硕士、西班牙语语言文学硕士、哲学硕士、历史硕士、人类学硕士、教育学硕士、心理教育学硕士等研究生课程。　B.本科课程：　提供法律、教育、科学、传播、宗教哲学、企业和经济、药物学、哲学语言、医学、神学等专业的本科课程。　C.英语密集课程：　西班牙语言及文学，西班牙历史，西班牙语贸易，拉丁文化研究。

　　专业设置：

　　人文、法律、社会学科：公共传媒、视听文化与传媒、管理法、教规与国家教会法、民法学、宪法学、劳动法、财政法与税法、国际私法、国际公法、商法、刑法、诉讼法、罗马法、企业学、信息企业学、语文学、哲学、法律哲学、地理与领土整治、历史、教会史、艺术史、法律史、人文学、牧师与传教士、新闻项目、圣经、教义神学、伦理与精神神学、历史神学；

　　实验与技术学科：变态反应学、临床免疫学、解剖学、麻醉学、植物生物学、生物化学、心脏病学、心血管外科学、食品学、生理学、毒物学、普通外科学、胃肠外科学、矫形外科学、创伤外科学、皮肤病学、消化系统、建筑学、内分泌学、社区护理、母婴护理、药剂学、物理学、应用数学、人体生理学、遗传学、预防医学与公共卫生、微生物和寄生虫学、神经与神经外科学、肿瘤学、耳鼻喉学、儿科、建筑理论与历史、药品研发与创新、城市规划、泌尿器学、动物学、生态学；

　　工程学：机械工程学、产业组织、基础科学、电力工程、电子工程、自动化工程、材料工程学；

　　高级商学院：决策分析、会计与监管、商业领导、组织人事领导、生产、技术、操作领导、财政领导、综合领导、经济学、企业伦理与神学、信息系统。