长崎大学1949年建校，位于长崎县长崎市的日本国立大学、引旧六所医科官立大学之一。1949年由长崎医科大学、长崎医科大学附属药学专门部、长崎经济专门学校（二战前为长崎高等商业学校）、长崎师范学校、长崎青年师范学校、引长崎高等学校合并而成。日本历史最悠久的公立医学校。

　　大学院

　　教育学研究科

　　教职实践专业（专业学位课程，教职大学院）

　　教科实践专业（修士课程）

　　经济学研究科（博士前期课程·博士后期课程）

　　工学研究科（2011年（平成23年）度比生产科学研究科从改组）

　　综合工学专业（博士前期课程）

　　生产系统工程专业（博士后期课程）

　　绿色系统创建科学专业（5年一贯博士课程）

　　水产·环境科学综合研究科（2011年（平成23年）度比生产科学研究科从改组）

　　水产学专业（博士前期课程）

　　环境保全设计专业（博士前期课程）

　　环境共生政策学专攻（博士前期课程）

　　海洋环境资源学专攻（博士后期课程）

　　海洋场生命科学专业（5年一贯博士课程）

　　医齿药学综合研究科

　　修士课程

　　热带医学专业

　　保健学专业

　　生命科学专业药

　　博士课程

　　医疗科学专攻

　　新兴感染症病情控制学系专业

　　放射线医学科学专攻

　　博士后期课程

　　生命科学专业药

　　国际健康开发研究科（修士课程）

　　国际健康开发专业

　　附直研究所

　　长崎大学热带医学研究所（坂本，通称：热研）