滋贺大学大津校区起源于1874年建立在大津市的滋贺県常规师范学校，1943年经重组为滋贺师范学校。1949年5月，滋贺大学的成立使滋贺师范学校与滋贺教员培训学校合并并归属于滋贺大学的人文教育学部。

　　彦根校区起源于1922年建于彦根市的高等商业学校，1944年更名为彦根经济专科学校。1949年5月，随滋贺大学的成立彦根经济专科学校归属为滋贺大学的经济学部。

　　大学本部设立在彦根校区。

　　自1949年滋贺大学建校以来的发展与重组情况：

　　1949

　　以国家学校基本法为基础且提供双性共同教育的滋贺国立大学建校。学校由大津校区的人文教育学部和彦根校区的经济学部而构成。同时彦根校区的主图书馆和大津校区的附属图书馆建馆

　　1951

　　人文教育学部附属小学与附属中学建校

　　1953

　　经济学专科学校成立并开设了企业管理夜间课程

　　1957

　　经济学部图书馆建馆

　　1963

　　四年制人文教育课程分为小学教师课程和中学教师课程

　　1966

　　人文教育学部改名为教育学部。

　　人文教育学部附属图书馆改名为教育学部图书馆。

　　开设了教育学资格专修课程

　　1967

　　开设了特殊教育教师专修课程经济学部经济历史资料馆改名为经济学部史料馆

　　1972

　　经济学部企业经营学科成立

　　1973

　　经济学部开设经济学与经商管理学研究生课程

　　废除经商管理会计学专修课程

　　1974

　　教育学部开设了幼教课程

　　1975

　　临时特殊教育专修课程开设

　　经济专科学校新添设了经商管理与商业信息处理课程

　　1976

　　教育学部湖泊研究中心改名为湖泊研究学院

　　1977

　　经济学部开设了会计学科

　　1978

　　滋贺大学保健中心与智障儿童特殊学校建成

　　1981

　　开设特殊教育资格专修课程（智障儿童教育）

　　废除临时特殊教育专修课程

　　1985

　　大学计算机中心面向全校的教职员工及学生开放

　　1990

　　经济学部开设信息科学学科。

　　依学部重组，经济学部进而添设了信息处理与企业经营学科

　　1991

　　研究生部成立，并颁发学校教学，特殊教学和科目教学（日语教育，

　　社会教育，自然科学教育，美术教育和英语教育）等学科的资格证书。

　　废除教育学资格专修课程。

　　经济学部开设金融学科，计算机中心改名为信息处理中心。

　　1992

　　教育学部开设在职教师培训中心。

　　1993

　　1993年3月以国家学校基本法为基础，经济专科学校被废除。与此同时，

　　经济学部面向已就业人员开设了夜间课程。

　　经济学部经商管理会计学科重组并更名为经商管理学科与会计学科，

　　同年新开设了社会系统学科。

　　经济学部产业共同研究所成立。

　　1994

　　在国家学校基本法的基础下，生涯教育学习研究所成立。

　　1995

　　湖泊研究学院重组并改名为环境教育湖泊研究中心

　　1997

　　经教育学部的重组，初中教师课程，特殊教育教师课程和幼教课程被 废除并更名为学校教育学科。

　　1999

　　智障儿童教育资格专修课程更名为智障儿童教育课程。

　　2000

　　经教育学部重组，信息科学课程更名为信息科学与教育课程并新开设了环境教育课程。现在的教育学部分为学校教育，信息科学与教育，环境教育3个研究领域。

　　教育学部的在职教师培训中心更名为教育实践研究所。

　　经济学部附属图书馆被废除。

　　2001

　　产业共同研究所变更为地方连携中心。

　　经济学部开设国际金融专业研究生课程。

　　留学生中心成立。

　　2002

　　地方连携中心成立。

　　2003

　　环境综合研究所成立。

　　2004

　　经济风险研究所成立。

　　2006

　　留学生中心改名为滋贺大学国际中心。