1901年设立为大韩耶稣教长老会平壤神学校，设立者为Samuel Austin Moffet。校训为“成为信徒、成为学者、成为圣者、成为传道者、成为牧人”。1938年因拒绝惨败神社而被闭校，1951年在大邱重新开校，1955年迁移到首尔并以大韩耶稣教长老会神学校获得财团法人的认可，1965年在现在的位置上新建并迁移校舍。1967年获得学校法人大韩耶稣教长老会总会的设立认可，1969年获得四年制正规大学的认可并改编为总神学院。1978年设置大学院，1995年更名为现在的校名。