先进的科研设备是提高科研效率必不可少的因素，瓦格宁根大学除提供良好的研究和教学设备外还提供好的研究场所，大学定期对它的教学设备进行调整。瓦格宁根大学先进的体育设施，现代化的餐厅和先进的研究设施都低价向学生开放。学校图书馆有大量有关生命科学自然与资源方面的藏书，学生也可以选择电子版书籍进行查阅。学校另外设有“未来餐厅”，学生可以对平时的食物饮品进行创新，实现了研究和实践巧妙独特的结合。