亚非学院分为三大学院：艺术及人文科学学院、语言及文化学院、法学及社会科学学院。这三个学院又由18个学术部门组成。亚非学院课程及专业设置广泛，有本科、授课型研究生、研究型研究生、预科等多种项目。

　　本科专业有：非洲语言及文化、古代近东研究、阿拉伯及伊斯兰研究、希伯来人及以色列研究、韩国语、日本语、印度尼西亚语、近代及古代汉语、中东研究、东南亚研究、南亚研究、斯瓦希里语、历史、艺术史及考古学、宗教研究、社会人类学、地理学、法学、经济学、政治学等等。

　　研究生专业有：中国文学、佛教研究、阿拉伯文学、古代近东语言、亚洲非洲历史、非洲文学、人类学的研究方法、法学、媒体人类学、食物人类学、亚洲非洲比较文学、汉语研究、性别研究及宗教、全球性电影及多元文化、艺术史及考古学、中国法学、历史的研究方法、人权法学、国际法、印度宗教、东南亚语言及文化、南亚语言及文化、人种音乐学、财经法、银行业、国际政治学、发展经济学等等。