圣约翰大学有五个分校区，有两个校园分别在罗马和意大利，其它有三个校区(Jamaica Queens Campus、Staten Island Campus以及Manhattan Campus)位于繁华的纽约市。美国圣约翰大学有7个学院，主要包括：文理学院、教育学院、商学院、医药和健康学院、职业发展学院、远距离教学学院、法学院。

　　圣约翰大学的法学院较负盛名，在破产法方面卓有声望。

　　文理学院是圣约翰大学最古老的学院，云集了众多的教授，学者和研究人员，文学学士，理学学士和艺术学士。文理学院的特色是在多元化的社会和现代化的教育环境中以学生教育为中心，除了培养学生的基本技能如写作和外语外，其他的课程设置是为了发展学生分析，辨证思考和解决问题的能力。而且该学院在文学、科学、商科和教育方面有三十多个专业和四十个辅修科目，所提供的三十个学位项目构成圣约翰大学的教育基础。

　　圣约翰大学的商学院有近80年的历史，在纽约地区颇具名望。其课程设置结合了先进科技、实践经验、扎实的知识基础、以及全球化的视野。商学院的教师致力于应用研究的同时，也把最新的商业发展动向带入了课堂。学院下设多个院系，包括：会计和税收、计算机信息系统和决策学、经济学和金融、商法、管理、市场、风险管理、保险和审计学。MBA项目具有自己的特色，MBA学生可以选择多个专业方向：会计、税收、决策学、金融、保险金融管理、国际商务、国际金融、风险管理、市场管理、计算机信息系统，等等。