与其他纽约州的私立大学相比，圣约翰大学每年二万多美元的学费算是相对便宜的。学校也向学生提供大量的经济资助。2004-2005学年，该校14300多名的学生受到超过24200万美元的不同形式的经济资助。圣约翰大学从2004年秋天起提供给新生和全职教师每人一台ibm的笔记本电脑，同时校园拥有的全美大学校园最完善的无线上网设施使学生在校园的几乎每一个角落都可以收发email或者访问互联网。